1（对植株本身）增强植物生物防控能力，提高抗病（虫）害、抗旱、耐劳、抗寒防冻的能力。大有益菌分泌植物促生物和抗生素，抑制病原微生物生长，提高对土传病的生物防控作用，提高抗重茬、枯萎、黄萎、根腐、根结线虫等病害的能力，使植物健壮、旺盛。
2（对土壤）改良土壤，增加土壤肥力。通过大有益微生物活动，促使土壤形成团粒结构，增加通透性，减轻土壤板结；提高保肥、保水能力；增强水、肥、气、热、菌五个肥力因素相互协调。
3（对植物根系）生根，养根、壮根。有益菌分泌物刺激根系迅速生长，对根系有修复和再生的功能，减少沤根，烂根，促进根系发达，使植株健壮，叶片肥厚，叶色浓绿，花色鲜艳，提高植物成活率。
4（提高肥料土壤利用率）制造和协调农作物吸收营养。多功能菌肥把土壤中植物不可溶的磷钾钙镁锌等释放游离出来供植物吸收，相当于在植物根系建立了微肥厂。产生的赤霉素，细胞分裂素，吲哚乙酸刺激根系生长，极大提高了肥料利用率。
5（调节土壤、无公害）降解硝酸盐和农药残留，修复土壤，提高农产品品。微生物的生命活动降低硝酸盐及农药残留，调节pH值，增加氨基酸、糖分、维生素等含，使瓜果菜色鲜味美，品良。
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